研发历程:2013年6月,经过280多人长达2年多的潜心研发,天河二号正式研制成功,随即登上TOP500榜单首位,一直保持到2016年初。中国超算的前世今生
整体结构:天河二号共有170个机柜,占地720平方米,包含计算阵列、服务阵列、存储子系统、互联通信子系统、监控诊断子系统等,如图所示。
计算节点:计算阵列全系统包含125个计算机柜,每个计算机柜包含4个计算插框,每个计算插框包含16个计算刀片,每个计算刀片包含2个计 算节点,因此计算阵列一共包含16000个计算节点。每个计算节点包含:2个Intel Xeon E5-2692 v2@2.2GHz 12核心处理器、 3个Intel Xeon Phi 31S1P 57核心协处理计算卡、64GB主存、高速互联接口、2个以太网接口。由于每个Xeon Phi处理器带有8G内存, 所以每个计算节点有88G内存,整体内存约为1.34PB。一个Xeon E5处理器峰值浮点计算能力为0.2112 TFlops, 一个Xeon Phi协处理器峰值浮点计算能力为1.003 TFlops,单节点峰值性能为3.4314 Tflops,计算阵列理论峰值浮点计算能力为54902.4 TFlops, 也就是每秒钟5.49亿亿次。天河二号计算节点运行Red Hat Enterprise Linux Server release 7.3 (Maipo)操作系统, 采用基于SLURM(Simple Linux Utility for Resource Management,简称SLURM)研发的作业调度系统,支持MPI编程,可以使用gcc、icc编译。
服务领域:新材料新能源、生物医疗健康、天文地理物理、工业设计制造、大气海洋环境和智慧城市云计算等方面的软件,在国防建设、科技创新、国民经济发展等各个方面发挥了重要作用
重大成果:中国商用飞机设计有限公司北京研究中心利用约2.4万CPU核开展了大型民机全参数气动优化设计;华大基因互联网支撑与发展中心负责人说,天河二号具有强大的计算能力,以500人规模的全基因组信息关联性分析 宇宙中微子数值模拟;
每个用户组(包含多个用户)拥有一个VPN账号,如果导师开通了主账户,学生开通子账户,那么向导师获取VPN账号即可。
子账户需要自己申请。给天河二号相关人员写申请邮件,并且抄送给导师或相关老师。
发送邮件之后,一般几天后就能收到回复,如果申请通过的话,回复邮件包含:新账号用户名、登录秘钥、使用说明书等
以下内容就是根据说明书编写的。
登录天河二号需要先登录天河二号专属VPN,再登录天河二号超级计算机。
下载安装VPN软件:下载VPN安装包,此处需要输入VPN账号密码才能下载。 软件设置:安装之后,打开VPN程序,输入以下配置: 服务器:vpn3.nscc-gz.cn或vpn1.nscc-gz.cn 端口号:4433 账号:VPN账号 密码:VPN密码 点击“登录”即可。
安装VPNC软件:debian、Ubuntu:sudo apt install vpnc ; centos、Fedora:sudo dnf install vpnc 启动vpnc:$ vpnc 设置登录参数:涉及保密,详情请联系网站管理员。
此时网络全部从vpn通过,而vpn只能传输天河二号数据,需要重新设置路由表: 1. 在能正常上网时先获取本地网关 route –n ,然后看Gateway一列 2. 在成功连接VPN之后添加两条明细路由: route add default gw X.X.X.X(原来正常上网的本地网关) route add -host 172.16.22.11 gw 172.16.3.254
安装VPNC软件:详情请联系网站管理员。 软件设置:详情请联系网站管理员。
这里使用Xshell软件,xshell官网提供教育版免费下载。
天河二号的账号空间没有BESIII计算集群那么多样,登陆之后默认进入/BIGDATA1/username,这里有1T存储空间。
有两种方法提交作业,分别是前台作业yhrun和后台作业yhbatch